Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMP3P54852 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMP3P54852 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMP3P54852 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMP3P54852 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMP3P54852 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMP3P54852 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMP3P54852 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMP3P54852 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMP3P54852 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMP3P54852 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMP3P54852 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMP3P54852 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMP3P54852 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMP3P54852 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMP3P54852 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms