Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms