Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC2P49815 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC2P49815 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC2P49815 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TSC2P49815 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC2P49815 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC2P49815 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC2P49815 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC2P49815 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC2P49815 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC2P49815 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC2P49815 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC2P49815 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC2P49815 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC2P49815 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC2P49815 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC2P49815 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC2P49815 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC2P49815 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC2P49815 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC2P49815 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC2P49815 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC2P49815 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC2P49815 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC2P49815 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC2P49815 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC2P49815 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC2P49815 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC2P49815 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC2P49815 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC2P49815 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC2P49815 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC2P49815 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC2P49815 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC2P49815 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC2P49815 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC2P49815 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms