Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF4A3P38919 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms