Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC5P28715 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms