Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSFA2P28290 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms