Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms