Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BCKDHBP21953 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCKDHBP21953 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDHBP21953 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHBP21953 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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