Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA1P17096 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGA1P17096 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA1P17096 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms