Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00869P0C866 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms