Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP3P08254 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP3P08254 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP3P08254 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP3P08254 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP3P08254 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP3P08254 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP3P08254 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP3P08254 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP3P08254 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP3P08254 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP3P08254 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP3P08254 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP3P08254 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP3P08254 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP3P08254 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP3P08254 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP3P08254 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP3P08254 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP3P08254 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP3P08254 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP3P08254 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms