Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3P05106 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms