Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4AP04350 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms