Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESR1P03372 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESR1P03372 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESR1P03372 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESR1P03372 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESR1P03372 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESR1P03372 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESR1P03372 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESR1P03372 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms