Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSA2O95478 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSA2O95478 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSA2O95478 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSA2O95478 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSA2O95478 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSA2O95478 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSA2O95478 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NSA2O95478 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSA2O95478 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSA2O95478 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSA2O95478 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSA2O95478 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSA2O95478 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSA2O95478 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSA2O95478 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSA2O95478 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSA2O95478 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSA2O95478 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSA2O95478 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSA2O95478 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSA2O95478 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSA2O95478 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSA2O95478 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms