Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3BO75182 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms