Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KERAO60938 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KERAO60938 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KERAO60938 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KERAO60938 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KERAO60938 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KERAO60938 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KERAO60938 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KERAO60938 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KERAO60938 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KERAO60938 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KERAO60938 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KERAO60938 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KERAO60938 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KERAO60938 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KERAO60938 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KERAO60938 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KERAO60938 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KERAO60938 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KERAO60938 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KERAO60938 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KERAO60938 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KERAO60938 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KERAO60938 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KERAO60938 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KERAO60938 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KERAO60938 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KERAO60938 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KERAO60938 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms