Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITM2AO43736 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms