Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC3O15379 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC3O15379 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 445.1 ms