Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP73O15350 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP73O15350 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP73O15350 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP73O15350 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP73O15350 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP73O15350 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP73O15350 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms