Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0S8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0S8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0S8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0S8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0S8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0S8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0S8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0S8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0S8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0S8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0S8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0S8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0S8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0S8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0S8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0S8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H7C0S8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H7C0S8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.1 ms