Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms