Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DGG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DGG1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DGG1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DGG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DGG1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4DGG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4DGG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DGG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DGG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DGG1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DGG1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DGG1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DGG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DGG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms