Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms