Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1Q9Y2B5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1Q9Y2B5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms