Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF6Q9Y252 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF6Q9Y252 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms