Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CGGBP1Q9UFW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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