Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms