Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK12Q9NYV4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms