Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX1Q9NSU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms