Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPCDR1Q9BY65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPCDR1Q9BY65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPCDR1Q9BY65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms