Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms