Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms