Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYD88Q99836 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms