Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.4 ms