Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHIPQ96QV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms