Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERAC1Q96JX3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms