Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXNL1Q96CM4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXNL1Q96CM4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXNL1Q96CM4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms