Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms