Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNQ92622 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms