Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LINC00301Q8NCQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms