Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPAS3Q8IXF0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms