Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms