Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A4Q6YBV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A4Q6YBV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms