Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC62Q6P9F0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms