Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFCAB12Q6NXP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 666.8 ms