Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDK2Q58EX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms