Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FHOD3Q2V2M9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms