Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCK2Q16822 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCK2Q16822 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCK2Q16822 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCK2Q16822 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms