Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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